On a déterminé les concentrations de tous les ADNc purifiés et les efficacités de chaque réaction d`étiquetage (colorant pmol/μg d`ADNc) à l`aide d`un spectrophotomètre NanoDrop ND-1000 et du programme de mesure de microarray. La ligne noire de chaque graphe correspond à la moyenne des profils d`expression des gènes composant le cluster. Une représentation précise de la réponse génomique déclenchée par les différents traitements a été obtenue en regroupant les gènes avec les profils d`expression les plus semblables dans un minimum de six groupes distincts (Fig. Conclusion. Par conséquent, aroA, citE, glyS, oppB et ASD ont tous été upregulés à 71 ° c comparativement à 60 ° c FO = 3 et peuvent donc prendre part aux fonctions biologiques actives finales des cellules avant la mort. De 60 ° c à 71 ° c, l`expression des deux chaperons diminue significativement et les niveaux d`ARNm DnaK et GroEL reviennent à un niveau basal à 71 ° c, semblable à celui observé chez les bactéries témoins à 37 ° c (Fig. Bien que chaque grappe contenait une grande proportion de cadres de lecture ouverts «hypothétiques», plusieurs distinctions peuvent être faites entre ces groupes en examinant les fonctions des gènes qui les composent (voir le tableau S2 dans le matériel supplémentaire). Les populations de cellules qui sont trop blessées ou stressées pour croître et former des colonies distinctes sont donc sous-estimées. Ainsi, les cellules VBNC devraient être une préoccupation majeure pour la salubrité des aliments, en particulier pendant le stockage prolongé où la récupération des cellules VBNC pourrait avoir des conséquences importantes pour la santé publique. La quantification a été normalisée à l`aide de deux gènes d`entretien ménager (ARNr 16S et 23S) et d`un gène non affecté par le traitement thermique, selon les résultats des MICROMATRICES (lptA). Ainsi, les grappes C1 et C3 étaient caractérisées par une proportion plus élevée de gènes impliqués dans la transcription (rseB, rssB, melR, greB, iclR, zur), les fonctions régulatrices (rpoD, envR, glcC, narQ, perR, rhaR, torR, rnhA, FNR) et les processus cellulaires (pour l`adaptation conditions, cspF, cspG, cspH et lpxP; pour la chimiotaxie et la motilité, flgC, flgM, fliC, fliL et fliM) que les clusters C2 et C6. Quatre traitements thermiques différents ont été effectués dans notre expérience.

Evaluation du rétablissement de la croissance et de l`intégrité des cellules après chauffage. Agilent Technologies Inc. Les augmentations significatives de l`expression aroA, cite et glyS entre 60 ° c avec FO = 3 et 71 ° c ont été confirmées par PCR en temps réel (P < 0. Les produits de PCR purifiés ont été quantifiés à l`aide d`un spectrophotomètre NanoDrop et utilisés pour établir des courbes standard pour chaque gène. Des études récentes ont rapporté que certaines souches d`Escherichia coli peuvent encore croître au-dessus de 65 ° c (3) et peuvent survivre dans le boeuf haché après une période de cuisson à la température interne recommandée de 71 ° c (8). En outre, les bactéries, qui ont déjà subi un choc thermique sublétal, deviennent plus résistantes au traitement ultérieur à des températures élevées (5 – 7).